Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNB1P35222 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNB1P35222 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNB1P35222 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms