Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PFN2P35080 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PFN2P35080 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PFN2P35080 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PFN2P35080 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PFN2P35080 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PFN2P35080 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PFN2P35080 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms