Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTX3P26022 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTX3P26022 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTX3P26022 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTX3P26022 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTX3P26022 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTX3P26022 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTX3P26022 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTX3P26022 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTX3P26022 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTX3P26022 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTX3P26022 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTX3P26022 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTX3P26022 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTX3P26022 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTX3P26022 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTX3P26022 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTX3P26022 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTX3P26022 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTX3P26022 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTX3P26022 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTX3P26022 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTX3P26022 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTX3P26022 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTX3P26022 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTX3P26022 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTX3P26022 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTX3P26022 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTX3P26022 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTX3P26022 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTX3P26022 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTX3P26022 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTX3P26022 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTX3P26022 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTX3P26022 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTX3P26022 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTX3P26022 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTX3P26022 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTX3P26022 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTX3P26022 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTX3P26022 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTX3P26022 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTX3P26022 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTX3P26022 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTX3P26022 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTX3P26022 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTX3P26022 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTX3P26022 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTX3P26022 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTX3P26022 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTX3P26022 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTX3P26022 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTX3P26022 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTX3P26022 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTX3P26022 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTX3P26022 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTX3P26022 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTX3P26022 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTX3P26022 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTX3P26022 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTX3P26022 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTX3P26022 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTX3P26022 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTX3P26022 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTX3P26022 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTX3P26022 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTX3P26022 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTX3P26022 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTX3P26022 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTX3P26022 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTX3P26022 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTX3P26022 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTX3P26022 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTX3P26022 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTX3P26022 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms