Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFKBIAP25963 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKBIAP25963 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms