Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRZ1P23471 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRZ1P23471 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRZ1P23471 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRZ1P23471 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRZ1P23471 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRZ1P23471 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms