Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR3P22607 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FGFR3P22607 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FGFR3P22607 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms