Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMNB1P20700 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMNB1P20700 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMNB1P20700 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms