Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNNI3P19429 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNNI3P19429 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms