Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRAP18433 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRAP18433 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPRAP18433 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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