Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SMPD1P17405 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPD1P17405 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPD1P17405 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms