Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STMN1P16949 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMN1P16949 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMN1P16949 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMN1P16949 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMN1P16949 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMN1P16949 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMN1P16949 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STMN1P16949 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STMN1P16949 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMN1P16949 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMN1P16949 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMN1P16949 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMN1P16949 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMN1P16949 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMN1P16949 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMN1P16949 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STMN1P16949 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STMN1P16949 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STMN1P16949 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMN1P16949 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMN1P16949 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMN1P16949 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMN1P16949 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMN1P16949 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMN1P16949 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMN1P16949 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMN1P16949 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STMN1P16949 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMN1P16949 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMN1P16949 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMN1P16949 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms