Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSH2P0DML3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSH2P0DML3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms