Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM200BP0CF97 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM200BP0CF97 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM200BP0CF97 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms