Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTMAP06454 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTMAP06454 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTMAP06454 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTMAP06454 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTMAP06454 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTMAP06454 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTMAP06454 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTMAP06454 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTMAP06454 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTMAP06454 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTMAP06454 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTMAP06454 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTMAP06454 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTMAP06454 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTMAP06454 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTMAP06454 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTMAP06454 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTMAP06454 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTMAP06454 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTMAP06454 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTMAP06454 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTMAP06454 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTMAP06454 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTMAP06454 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTMAP06454 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTMAP06454 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTMAP06454 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTMAP06454 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTMAP06454 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTMAP06454 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTMAP06454 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTMAP06454 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTMAP06454 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTMAP06454 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTMAP06454 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTMAP06454 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTMAP06454 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTMAP06454 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTMAP06454 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTMAP06454 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTMAP06454 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTMAP06454 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTMAP06454 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTMAP06454 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTMAP06454 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTMAP06454 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTMAP06454 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTMAP06454 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTMAP06454 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTMAP06454 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTMAP06454 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTMAP06454 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTMAP06454 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTMAP06454 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTMAP06454 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTMAP06454 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTMAP06454 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTMAP06454 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTMAP06454 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTMAP06454 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTMAP06454 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTMAP06454 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTMAP06454 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTMAP06454 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTMAP06454 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTMAP06454 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTMAP06454 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTMAP06454 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTMAP06454 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms