Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLR3DP05423 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms