Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL2A1P02458 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL2A1P02458 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL2A1P02458 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms