Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRUB2O95900 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRUB2O95900 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms