Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SEC24BO95487 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEC24BO95487 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC24BO95487 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms