Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN3O95197 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN3O95197 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN3O95197 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN3O95197 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN3O95197 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN3O95197 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN3O95197 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN3O95197 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN3O95197 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN3O95197 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN3O95197 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN3O95197 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN3O95197 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN3O95197 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN3O95197 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN3O95197 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN3O95197 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN3O95197 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN3O95197 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN3O95197 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN3O95197 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN3O95197 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN3O95197 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN3O95197 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN3O95197 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN3O95197 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN3O95197 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN3O95197 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN3O95197 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTN3O95197 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTN3O95197 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN3O95197 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN3O95197 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN3O95197 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN3O95197 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN3O95197 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN3O95197 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN3O95197 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN3O95197 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RTN3O95197 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTN3O95197 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN3O95197 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN3O95197 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN3O95197 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN3O95197 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN3O95197 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN3O95197 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN3O95197 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN3O95197 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN3O95197 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN3O95197 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN3O95197 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN3O95197 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN3O95197 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN3O95197 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN3O95197 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms