Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UFL1O94874 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UFL1O94874 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UFL1O94874 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UFL1O94874 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UFL1O94874 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UFL1O94874 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UFL1O94874 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UFL1O94874 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UFL1O94874 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UFL1O94874 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UFL1O94874 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UFL1O94874 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UFL1O94874 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UFL1O94874 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UFL1O94874 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UFL1O94874 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UFL1O94874 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UFL1O94874 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UFL1O94874 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UFL1O94874 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UFL1O94874 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UFL1O94874 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UFL1O94874 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UFL1O94874 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UFL1O94874 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UFL1O94874 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UFL1O94874 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UFL1O94874 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UFL1O94874 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UFL1O94874 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UFL1O94874 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UFL1O94874 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UFL1O94874 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UFL1O94874 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UFL1O94874 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UFL1O94874 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UFL1O94874 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UFL1O94874 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UFL1O94874 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UFL1O94874 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
UFL1O94874 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UFL1O94874 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UFL1O94874 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UFL1O94874 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UFL1O94874 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UFL1O94874 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
UFL1O94874 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UFL1O94874 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UFL1O94874 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UFL1O94874 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UFL1O94874 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UFL1O94874 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UFL1O94874 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UFL1O94874 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UFL1O94874 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UFL1O94874 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UFL1O94874 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UFL1O94874 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UFL1O94874 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UFL1O94874 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UFL1O94874 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UFL1O94874 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
UFL1O94874 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UFL1O94874 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UFL1O94874 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UFL1O94874 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UFL1O94874 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UFL1O94874 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UFL1O94874 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UFL1O94874 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UFL1O94874 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UFL1O94874 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UFL1O94874 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
UFL1O94874 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UFL1O94874 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
UFL1O94874 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
UFL1O94874 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UFL1O94874 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UFL1O94874 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UFL1O94874 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UFL1O94874 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UFL1O94874 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UFL1O94874 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UFL1O94874 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UFL1O94874 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UFL1O94874 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UFL1O94874 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UFL1O94874 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UFL1O94874 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
UFL1O94874 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms