Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3JO75822 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF3JO75822 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF3JO75822 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms