Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC45O75419 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDC45O75419 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC45O75419 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC45O75419 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC45O75419 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC45O75419 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC45O75419 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC45O75419 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC45O75419 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC45O75419 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC45O75419 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC45O75419 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC45O75419 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC45O75419 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC45O75419 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDC45O75419 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDC45O75419 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC45O75419 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC45O75419 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC45O75419 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC45O75419 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC45O75419 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC45O75419 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC45O75419 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC45O75419 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC45O75419 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC45O75419 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC45O75419 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC45O75419 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC45O75419 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC45O75419 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC45O75419 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC45O75419 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC45O75419 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC45O75419 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC45O75419 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC45O75419 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC45O75419 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC45O75419 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC45O75419 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC45O75419 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC45O75419 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC45O75419 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC45O75419 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC45O75419 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC45O75419 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC45O75419 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC45O75419 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC45O75419 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC45O75419 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC45O75419 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC45O75419 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC45O75419 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC45O75419 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC45O75419 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC45O75419 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC45O75419 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC45O75419 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC45O75419 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC45O75419 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC45O75419 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC45O75419 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC45O75419 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC45O75419 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC45O75419 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC45O75419 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC45O75419 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC45O75419 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms