Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRPX2O60687 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRPX2O60687 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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