Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSCO60682 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSCO60682 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSCO60682 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSCO60682 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MSCO60682 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSCO60682 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSCO60682 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSCO60682 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSCO60682 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSCO60682 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSCO60682 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MSCO60682 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSCO60682 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSCO60682 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSCO60682 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MSCO60682 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSCO60682 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSCO60682 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSCO60682 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MSCO60682 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSCO60682 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSCO60682 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSCO60682 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSCO60682 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSCO60682 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSCO60682 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MSCO60682 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSCO60682 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSCO60682 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSCO60682 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSCO60682 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSCO60682 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MSCO60682 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSCO60682 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSCO60682 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSCO60682 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSCO60682 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MSCO60682 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSCO60682 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSCO60682 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSCO60682 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSCO60682 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSCO60682 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSCO60682 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSCO60682 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSCO60682 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSCO60682 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MSCO60682 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MSCO60682 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MSCO60682 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSCO60682 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSCO60682 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSCO60682 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSCO60682 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSCO60682 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSCO60682 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MSCO60682 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms