Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REV3LO60673 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REV3LO60673 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REV3LO60673 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REV3LO60673 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REV3LO60673 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REV3LO60673 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REV3LO60673 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REV3LO60673 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REV3LO60673 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REV3LO60673 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REV3LO60673 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REV3LO60673 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REV3LO60673 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REV3LO60673 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REV3LO60673 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
REV3LO60673 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REV3LO60673 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REV3LO60673 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REV3LO60673 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REV3LO60673 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REV3LO60673 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REV3LO60673 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REV3LO60673 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REV3LO60673 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REV3LO60673 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REV3LO60673 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REV3LO60673 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REV3LO60673 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REV3LO60673 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
REV3LO60673 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
REV3LO60673 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
REV3LO60673 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
REV3LO60673 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REV3LO60673 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REV3LO60673 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REV3LO60673 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REV3LO60673 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REV3LO60673 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REV3LO60673 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REV3LO60673 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REV3LO60673 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REV3LO60673 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV3LO60673 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV3LO60673 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
REV3LO60673 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV3LO60673 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV3LO60673 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
REV3LO60673 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REV3LO60673 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REV3LO60673 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REV3LO60673 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REV3LO60673 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REV3LO60673 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
REV3LO60673 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REV3LO60673 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REV3LO60673 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REV3LO60673 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REV3LO60673 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REV3LO60673 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REV3LO60673 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REV3LO60673 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REV3LO60673 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REV3LO60673 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
REV3LO60673 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
REV3LO60673 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
REV3LO60673 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
REV3LO60673 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
REV3LO60673 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
REV3LO60673 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
REV3LO60673 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
REV3LO60673 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV3LO60673 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV3LO60673 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV3LO60673 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV3LO60673 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV3LO60673 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV3LO60673 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV3LO60673 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV3LO60673 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REV3LO60673 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms