Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPLO60437 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPLO60437 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PPLO60437 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PPLO60437 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPLO60437 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPLO60437 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPLO60437 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPLO60437 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PPLO60437 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PPLO60437 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PPLO60437 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPLO60437 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PPLO60437 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPLO60437 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPLO60437 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPLO60437 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPLO60437 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPLO60437 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PPLO60437 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPLO60437 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPLO60437 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPLO60437 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPLO60437 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPLO60437 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPLO60437 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PPLO60437 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PPLO60437 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PPLO60437 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PPLO60437 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PPLO60437 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PPLO60437 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PPLO60437 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PPLO60437 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PPLO60437 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PPLO60437 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PPLO60437 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PPLO60437 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PPLO60437 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PPLO60437 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PPLO60437 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PPLO60437 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PPLO60437 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PPLO60437 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PPLO60437 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PPLO60437 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PPLO60437 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PPLO60437 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PPLO60437 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PPLO60437 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PPLO60437 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PPLO60437 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPLO60437 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPLO60437 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPLO60437 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPLO60437 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPLO60437 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPLO60437 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPLO60437 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPLO60437 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPLO60437 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PPLO60437 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PPLO60437 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PPLO60437 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PPLO60437 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PPLO60437 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PPLO60437 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PPLO60437 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PPLO60437 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PPLO60437 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PPLO60437 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PPLO60437 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
PPLO60437 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PPLO60437 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PPLO60437 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PPLO60437 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PPLO60437 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PPLO60437 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PPLO60437 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PPLO60437 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PPLO60437 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PPLO60437 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms