Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF9O60383 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF9O60383 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF9O60383 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF9O60383 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF9O60383 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF9O60383 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF9O60383 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF9O60383 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF9O60383 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF9O60383 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF9O60383 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF9O60383 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF9O60383 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF9O60383 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF9O60383 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF9O60383 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF9O60383 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF9O60383 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF9O60383 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF9O60383 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF9O60383 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF9O60383 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF9O60383 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF9O60383 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF9O60383 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF9O60383 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF9O60383 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF9O60383 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF9O60383 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF9O60383 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF9O60383 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF9O60383 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF9O60383 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF9O60383 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF9O60383 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF9O60383 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF9O60383 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF9O60383 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF9O60383 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF9O60383 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF9O60383 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF9O60383 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF9O60383 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF9O60383 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF9O60383 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF9O60383 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms