Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKNO60260 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKNO60260 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKNO60260 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKNO60260 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKNO60260 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKNO60260 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKNO60260 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKNO60260 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKNO60260 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKNO60260 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKNO60260 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKNO60260 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKNO60260 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKNO60260 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKNO60260 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKNO60260 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKNO60260 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKNO60260 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKNO60260 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKNO60260 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKNO60260 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKNO60260 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKNO60260 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKNO60260 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKNO60260 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKNO60260 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKNO60260 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKNO60260 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKNO60260 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKNO60260 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKNO60260 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKNO60260 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKNO60260 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKNO60260 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKNO60260 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKNO60260 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKNO60260 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKNO60260 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKNO60260 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKNO60260 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKNO60260 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKNO60260 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKNO60260 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKNO60260 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKNO60260 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKNO60260 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKNO60260 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKNO60260 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKNO60260 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKNO60260 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKNO60260 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKNO60260 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKNO60260 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms