Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKAB2O43741 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKAB2O43741 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKAB2O43741 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKAB2O43741 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKAB2O43741 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKAB2O43741 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKAB2O43741 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRKAB2O43741 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PRKAB2O43741 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKAB2O43741 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKAB2O43741 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms