Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN6O43657 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms