Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMTOR5O43504 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMTOR5O43504 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms