Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXA3O43365 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA3O43365 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA3O43365 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA3O43365 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA3O43365 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA3O43365 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA3O43365 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA3O43365 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXA3O43365 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms