Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF5O14894 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TM4SF5O14894 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.8 ms