Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CITO14578 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CITO14578 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CITO14578 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CITO14578 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CITO14578 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CITO14578 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CITO14578 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CITO14578 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CITO14578 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CITO14578 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CITO14578 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CITO14578 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CITO14578 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CITO14578 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CITO14578 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CITO14578 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CITO14578 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CITO14578 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CITO14578 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CITO14578 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CITO14578 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CITO14578 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CITO14578 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CITO14578 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CITO14578 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CITO14578 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CITO14578 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CITO14578 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CITO14578 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CITO14578 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CITO14578 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CITO14578 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CITO14578 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CITO14578 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CITO14578 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CITO14578 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CITO14578 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CITO14578 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CITO14578 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CITO14578 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CITO14578 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CITO14578 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CITO14578 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CITO14578 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CITO14578 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CITO14578 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CITO14578 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CITO14578 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CITO14578 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CITO14578 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CITO14578 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CITO14578 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CITO14578 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CITO14578 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CITO14578 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CITO14578 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CITO14578 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CITO14578 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CITO14578 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CITO14578 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CITO14578 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CITO14578 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CITO14578 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CITO14578 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CITO14578 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CITO14578 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CITO14578 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CITO14578 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CITO14578 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms