Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HSPB6O14558 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSPB6O14558 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms