Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CUX2O14529 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CUX2O14529 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CUX2O14529 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CUX2O14529 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
CUX2O14529 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CUX2O14529 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CUX2O14529 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CUX2O14529 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
CUX2O14529 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CUX2O14529 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CUX2O14529 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CUX2O14529 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CUX2O14529 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CUX2O14529 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CUX2O14529 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CUX2O14529 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CUX2O14529 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CUX2O14529 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CUX2O14529 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CUX2O14529 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CUX2O14529 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CUX2O14529 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CUX2O14529 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CUX2O14529 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CUX2O14529 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CUX2O14529 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CUX2O14529 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CUX2O14529 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CUX2O14529 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
CUX2O14529 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CUX2O14529 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
CUX2O14529 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
CUX2O14529 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CUX2O14529 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
CUX2O14529 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CUX2O14529 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CUX2O14529 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CUX2O14529 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CUX2O14529 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CUX2O14529 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CUX2O14529 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CUX2O14529 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CUX2O14529 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CUX2O14529 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CUX2O14529 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CUX2O14529 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CUX2O14529 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CUX2O14529 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CUX2O14529 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CUX2O14529 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CUX2O14529 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CUX2O14529 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
CUX2O14529 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CUX2O14529 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
CUX2O14529 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC40.06■■■■■ 4
CUX2O14529 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CUX2O14529 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
CUX2O14529 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
CUX2O14529 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CUX2O14529 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CUX2O14529 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CUX2O14529 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CUX2O14529 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CUX2O14529 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CUX2O14529 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
CUX2O14529 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CUX2O14529 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CUX2O14529 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
CUX2O14529 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CUX2O14529 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CUX2O14529 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CUX2O14529 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CUX2O14529 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CUX2O14529 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CUX2O14529 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CUX2O14529 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CUX2O14529 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CUX2O14529 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CUX2O14529 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
CUX2O14529 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CUX2O14529 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CUX2O14529 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CUX2O14529 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CUX2O14529 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CUX2O14529 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CUX2O14529 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CUX2O14529 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CUX2O14529 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CUX2O14529 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms