Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GFRA2O00451 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms