Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE2AO00408 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE2AO00408 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms