Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIP1O00291 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIP1O00291 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIP1O00291 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIP1O00291 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIP1O00291 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIP1O00291 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIP1O00291 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIP1O00291 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIP1O00291 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIP1O00291 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIP1O00291 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIP1O00291 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIP1O00291 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIP1O00291 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIP1O00291 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIP1O00291 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIP1O00291 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIP1O00291 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIP1O00291 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIP1O00291 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIP1O00291 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIP1O00291 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIP1O00291 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIP1O00291 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIP1O00291 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HIP1O00291 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIP1O00291 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HIP1O00291 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIP1O00291 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIP1O00291 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HIP1O00291 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIP1O00291 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIP1O00291 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HIP1O00291 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIP1O00291 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIP1O00291 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIP1O00291 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIP1O00291 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIP1O00291 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIP1O00291 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HIP1O00291 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIP1O00291 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HIP1O00291 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIP1O00291 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIP1O00291 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIP1O00291 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIP1O00291 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HIP1O00291 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIP1O00291 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIP1O00291 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIP1O00291 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIP1O00291 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIP1O00291 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HIP1O00291 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HIP1O00291 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIP1O00291 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HIP1O00291 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIP1O00291 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIP1O00291 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIP1O00291 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIP1O00291 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIP1O00291 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIP1O00291 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HIP1O00291 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIP1O00291 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIP1O00291 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIP1O00291 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIP1O00291 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIP1O00291 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HIP1O00291 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HIP1O00291 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HIP1O00291 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HIP1O00291 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HIP1O00291 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HIP1O00291 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HIP1O00291 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HIP1O00291 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms