Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NFKBIEO00221 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFKBIEO00221 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms