Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
H3BRB1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BRB1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BRB1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BRB1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BRB1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BRB1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H3BRB1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H3BRB1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BRB1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BRB1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BRB1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BRB1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BRB1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BRB1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BRB1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BRB1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BRB1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BRB1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H3BRB1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BRB1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BRB1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BRB1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BRB1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BRB1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BRB1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BRB1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BRB1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BRB1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BRB1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BRB1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BRB1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BRB1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BRB1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BRB1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BRB1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BRB1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BRB1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BRB1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BRB1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BRB1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BRB1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BRB1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BRB1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BRB1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BRB1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BRB1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BRB1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BRB1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BRB1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BRB1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BRB1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BRB1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BRB1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BRB1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BRB1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BRB1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BRB1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BRB1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BRB1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BRB1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BRB1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BRB1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BRB1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BRB1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BRB1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BRB1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BRB1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BRB1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BRB1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BRB1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BRB1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BRB1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BRB1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BRB1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BRB1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BRB1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BRB1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BRB1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BRB1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms