Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNC9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNC9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BNC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BNC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BNC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BNC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNC9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNC9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNC9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNC9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNC9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BNC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BNC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BNC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BNC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNC9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNC9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BNC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BNC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BNC9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BNC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BNC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms