Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PMD0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PMD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PMD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E9PMD0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PMD0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PMD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PMD0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PMD0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PMD0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PMD0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E9PMD0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PMD0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
E9PMD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PMD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PMD0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PMD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PMD0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PMD0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PMD0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PMD0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PMD0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
E9PMD0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PMD0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PMD0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PMD0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PMD0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PMD0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PMD0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PMD0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E9PMD0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PMD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PMD0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PMD0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PMD0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E9PMD0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E9PMD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E9PMD0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
E9PMD0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E9PMD0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
E9PMD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
E9PMD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E9PMD0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E9PMD0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E9PMD0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E9PMD0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
E9PMD0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E9PMD0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E9PMD0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
E9PMD0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E9PMD0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E9PMD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E9PMD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E9PMD0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E9PMD0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E9PMD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
E9PMD0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E9PMD0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E9PMD0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E9PMD0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E9PMD0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E9PMD0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E9PMD0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E9PMD0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E9PMD0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E9PMD0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E9PMD0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E9PMD0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E9PMD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E9PMD0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E9PMD0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E9PMD0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E9PMD0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E9PMD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E9PMD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E9PMD0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E9PMD0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E9PMD0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E9PMD0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E9PMD0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms