Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.8■■■■□ 3
E9PCH4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
E9PCH4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
E9PCH4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
E9PCH4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
E9PCH4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
E9PCH4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.79■■■■□ 3
E9PCH4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
E9PCH4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
E9PCH4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
E9PCH4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
E9PCH4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
E9PCH4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
E9PCH4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
E9PCH4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
E9PCH4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
E9PCH4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
E9PCH4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
E9PCH4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
E9PCH4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
E9PCH4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
E9PCH4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
E9PCH4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
E9PCH4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
E9PCH4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
E9PCH4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
E9PCH4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
E9PCH4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
E9PCH4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
E9PCH4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
E9PCH4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
E9PCH4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
E9PCH4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
E9PCH4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
E9PCH4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
E9PCH4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
E9PCH4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
E9PCH4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
E9PCH4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
E9PCH4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
E9PCH4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
E9PCH4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
E9PCH4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
E9PCH4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
E9PCH4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
E9PCH4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
E9PCH4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
E9PCH4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
E9PCH4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
E9PCH4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
E9PCH4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
E9PCH4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
E9PCH4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
E9PCH4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
E9PCH4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
E9PCH4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
E9PCH4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
E9PCH4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
E9PCH4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
E9PCH4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
E9PCH4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
E9PCH4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
E9PCH4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
E9PCH4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
E9PCH4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
E9PCH4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
E9PCH4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
E9PCH4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
E9PCH4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
E9PCH4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
E9PCH4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
E9PCH4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
E9PCH4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms