Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf172C9J069 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf172C9J069 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf172C9J069 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms