Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VGLL3A8MV65 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VGLL3A8MV65 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms