Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CYSRT1A8MQ03 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYSRT1A8MQ03 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms