Protein–RNA interactions for Protein: A7E2F4

GOLGA8A, Golgin subfamily A member 8A, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8AA7E2F4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA8AA7E2F4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA8AA7E2F4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA8AA7E2F4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms