Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP27XA6NNY8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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