Protein–RNA interactions for Protein: A6NNN8

SLC38A8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A8A6NNN8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC38A8A6NNN8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A8A6NNN8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A8A6NNN8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms